Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms