Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3bp1P55194 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms