Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NrlP54846 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NrlP54846 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms