Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms