Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ClgnP52194 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClgnP52194 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms