Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ApodP51910 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ApodP51910 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ApodP51910 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ApodP51910 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ApodP51910 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms