Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Apobec1P51908 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Apobec1P51908 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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