Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa6P50704 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms