Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TspoP50637 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TspoP50637 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TspoP50637 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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