Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LtbrP50284 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms