Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms