Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VdrP48281 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VdrP48281 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VdrP48281 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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