Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sipa1P46062 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sipa1P46062 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sipa1P46062 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sipa1P46062 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sipa1P46062 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sipa1P46062 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms