Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtgfrP43117 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms