Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx1-2P42580 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx1-2P42580 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms