Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VhlP40338 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VhlP40338 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VhlP40338 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms