Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tjp1P39447 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms