Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Traf1P39428 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms