Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lig1P37913 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lig1P37913 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lig1P37913 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lig1P37913 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms