Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms