Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Stfa3P35173 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms