Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pola2P33611 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pola2P33611 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms