Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rom1P32958 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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