Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DesP31001 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DesP31001 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DesP31001 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DesP31001 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DesP31001 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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