Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms