Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn10P28658 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms