Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BgnP28653 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BgnP28653 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BgnP28653 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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