Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjb3P28231 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjb3P28231 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms