Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pde6aP27664 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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