Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afxP27661 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms