Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmo2P25801 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms