Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nfkb1P25799 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nfkb1P25799 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms