Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd8P23463 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms