Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PparaP23204 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PparaP23204 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms