Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms