Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fcer1aP20489 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms