Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms