Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnnc1P19123 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms