Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms