Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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