Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms