Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb2P13373 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms