Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calb1P12658 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms