Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lamp1P11438 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms