Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms