Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl2P10148 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms