Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CatspereP0DP43 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms