Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
UbbP0CG49 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UbbP0CG49 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms