Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pla2g4bP0C871 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms