Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a2P08122 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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